भारतीय नौसेना के बेड़े (फ्लीट) के पास पाकिस्तान के अंदर के टारगेट की पूरी लिस्ट थी. उन्हें ऑपरेशन सिन्दूर के दौरान एक से अधिक मौकों पर पाकिस्तान के अंदर टारगेट पर मिसाइलें लॉन्च करने के लिए हॉट-स्टैंडबाय पर रखा गया था. सूत्रों ने एनडीटीवी को बताया है कि नौसेना को मिसाइल लॉन्च का अंतिम आदेश नहीं मिला. सूत्र के अनुसार, “नौसेना ने पहचाने गए टारगेट पर हमला नहीं किया. इसमें बंदरगाह पर लगे पाकिस्तान नौसेना के जहाज, पनडुब्बियों के साथ और जमीनी टारगेट शामिल थीं.” नौसेना ने अगर चौतरफा हमला किया होता तो ऑपरेशन सिन्दूर के दौरान दोनों देशों के बीच सैन्य शत्रुता में बहुत बड़ी वृद्धि हुई होती.
